سیدمجتبی حسینی در سالیان اخیر بیشتر از هر مربی دیگری بازیکنان جوان را در ترکیب تیم‌های خود قرار داده و ستاره‌های پرشماری به فوتبال ایران معرفی کرده که اکنون هم در تیم خود مهره‌های جوان و شاخصی مثل محمدمهدی لطفی، عارف حاجی‌عیدی، محمد خلیفه، بهرام گودرزی و... دارد و آنها را در تمام بازی‌های این فصل در ترکیب قرار داده است.
مجتبی حسینی که در کنار اعتماد و فرصت ویژه به جوانان، مهره‌های با تجربه با کیفیتی هم در تیمش دارد، در دیدار مقابل پرسپولیس دو بازیکن زیر 20 سال را در جمع 11 بازیکن اصلی قرار داد و علاوه بر آن، 3 مهره زیر 20 سال هم به‌عنوان بازیکن ذخیره به زمین فرستاد.
سیاوش اکبرپور، ستاره پیشین استقلال و سرمربی سابق تیم جوانان این باشگاه، در برنامه فوتبال برتر به تمجید از سرمربی آلومینیوم اراک پرداخت و گفت: جا دارد در اینجا از آقای مجتبی حسینی تشکر کنم. چند بازیکن خودم (در رده پایه) اکنون زیر نظر آقای حسینی هستند و انقدر مربی با دل و جراتی است که خودش را فدای جوانان می‌کند.
او ادامه داد: آقای حسینی با این کار آینده فوتبال ایران را می‌سازد و از ایشان بسیار تشکر می‌کنم و ان‌شاالله موفق باشد.
رضا جباری، مهاجم گلزن سابق پرسپولیس که تجربه چهار سال هدایت تیم نوجوانان این باشگاه را داشته نیز در ادامه اظهارات اکبرپور گفت: این تغییر در فوتبال که صحبت می‌کنیم، یعنی مجتبی حسینی. این تغییر را در فوتبال ایجاد کرده و کار ارزشمندی است و باید از او تقدیر شود.
