محسن هاشمی در واکنش به ادعای سکوت آیت الله هاشمی در مقابل برخی اقدامات وزارت اطلاعات نوشت: «موارد متعددی از تذکرات صریح ایشان به عنوان رییس جمهور، به وزیر اطلاعات قید شده و ایشان در زمان تشکیل دولت دوم، قصد جابجایی وزیر اطلاعات را داشت.»
محسن هاشمی رفسنجانی در حساب شخصی خود در توییتر نوشت: «می‌گویند چرا آیت الله هاشمی نسبت به خطاهای موجود در عملکرد وزارت اطلاعات در دولت سازندگی سکوت کرد، در حالیکه موارد متعددی از تذکرات صریح ایشان به عنوان رییس جمهور، به وزیر اطلاعات قید شده و ایشان در زمان تشکیل دولت دوم، قصد جابجایی وزیر اطلاعات را داشت که با این موضوع موافقت نشد.
اما روش آیت‌الله هاشمی همواره تعامل با مجموعه نظام، نه تقابل و نه انفعال بود، همین موضوع نیز بعضا در دوره روسای جمهور بعد رخ داد و نتیجه آن، وزیر اطلاعات تحمیلی و عزل بدون هماهنگی وزیر اطلاعات برای دولت، کشور و نظام هزینه بیشتری ایجاد کرد.»
