در چند سال اخیر کمبود آب ناشی از خشکسالی و احداث سد در مسیر رودخانه‌های منتهی به تالاب هورالعظیم آسیب‌های قابل توجهی به این زیستگاه وارد کرده است. بخشی از پدیده گرد و غبار جنوب کشور نیز به خشک شدن این تالاب مربوط است.بسیاری آتش‌سوزی تالاب هورالعظیم را در چند روز اخیر ناشی از خشکی این تالاب دانسته‌اند.